由于恶性肿瘤严重威胁人类的健康和生命，世界各国均投入了大量的人力和物力从事癌症的研究。目前恶性肿瘤的治疗已不仅仅是过去传统的手术、化学、放射三大治疗手段，还包括了进展迅速的生物治疗以及各种支持治疗手段。即使是仍采用手术、化学、放射等传统治疗手段，但其所采用的技术、药物等已非昔日所能比。尽管在恶性肿瘤的治疗中已取得了令人瞩目的成绩，但离人们的要求仍相差甚远。
在我国，消化道肿瘤一直严重威胁人们的健康，随着人民生活水平的改善，食道癌、胃癌的发病率已有所下降，但大肠癌较过去却有所上升。目前手术治疗仍是消化道肿瘤的主要治疗方法，也是姑息性治疗的主要手段之一。一部分早期患者可通过手术而获得治愈。但由于目前我国的现状是重治疗轻预防，所以肿瘤患者被发现时多数已属中晚期，因此仅仅通过手术而获得治愈的可能性大为下降。必须配合其他治疗手段才能获得较高的治愈率和较长的生存期。
放射治疗对食道癌的治疗有着不可或缺的作用，尤其是无法手术切除的食道癌患者。放射治疗对不能手术切除的胃癌病人帮助不大，其原因是胃的不断蠕动难以进行解剖定位及胃腺癌细胞对放射治疗的抗拒。但放射治疗可以缓解贲门癌梗阻症状和减轻不能切除病变的慢性出血，还可以对术中的胃癌患者进行治疗。放射治疗对直肠癌的术后巩固治疗及不能手术的直肠癌梗阻患者也有重要的作用。
化学治疗即通俗常讲的化疗，化疗通常用于恶性肿瘤的术前、术中、术后以及恶性肿瘤的姑息治疗。化疗作为目前肿瘤综合治疗重要组成部分，已在消化道肿瘤治疗中取得了长足的进步。比较有效的药物除了有传统的5-氟尿嘧啶、呋喃氟尿嘧啶、优福啶、丝裂霉素C、阿霉素、环己亚硝脲、顺氯氨铂等外，还开发出了许多新药如希罗达、奥沙利铂、紫杉类药物、喜树硷类等化疗药物。化疗方法主要有单剂化疗和联合化疗，但一般认为联合化疗的效果优于单剂化疗。
术前化疗可提高手术治疗的疗效。术中化疗是防止医源性播散的重要措施之一。术后辅助化疗是消化道癌最常用的综合治疗方法。术后化疗多采用联合化疗，联合化疗方案的种类繁多，但一般均以5-Fu及DDP为基本药物。术后辅助化疗可以预防肿瘤患者术后复发。化疗对于术后复发病人具有重要的姑息治疗作用。腹腔化疗在消化道肿瘤治疗中有特殊地位，尤其是有腹腔淋巴结转移和浆膜受侵犯的肿瘤患者，前瞻性的研究表明腹腔化疗可减少腹腔内复发和肝转移。
随着科学技术的进步，生物治疗逐步摆脱了过去人们所认识的理论上的巨人，临床上的矮子的认识，成为了真正有效的治疗手段。这在淋巴瘤、乳腺癌的治疗中已得到证实。在消化道肿瘤中研究较多的是大肠癌，目前主要的治疗手段有：1、单克隆抗体：如抗血管内皮生长因子的单抗贝伐单抗(Bevacizumab、Avastin);如抗表皮生长因子受体的单抗西妥昔单抗(Cetuximab、C-225、Erbitin)。胃癌her-2过表达的患者还可使用赫赛汀治疗。2、肿瘤疫苗：如肿瘤细胞疫苗、多肽疫苗、病毒疫苗、蛋白疫苗、树突状细胞疫苗等。尤其是单克隆抗体联合化疗等手段已取得了较好的疗效。分子靶向治疗药物中，格列卫对胃肠间质瘤的治疗具有不俗的表现。
各种支持治疗手段对延长肿瘤患者的生存具有积极的作用。其中各种支架对解除食道、胃肠道的梗阻具有重要的作用;胃肠外营养对晚期肿瘤患者是非常重要的;各种止吐药、升白细胞药等对完成肿瘤患者的放、化疗具有不可低估的作用。
中医中药治疗恶性肿瘤在我国已有几千年的历史。配合中医中药治疗可减轻毒副反应，加强抗癌作用，增强免疫功能，防止复发转移，提高生存质量和生存率。中医中药还可作为西医治疗完成后的后续治疗。